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近年来，玉米生产中种子质量事故时有发生，影响了农业生产，损害了农民利益。1995年，笔者在玉米灌浆成熟期间深入到中牟县、济源市的部分乡镇50多户玉米生产田进行调查，发现多数田中均不同程度地存在玉米杂交种纯度不高等问题。生产实践证明，玉米产量的提高主要依赖于优良品种的采用和生产用种质垦的提高，因此，在玉米杂交种的繁育、经营和推广种植工作中，正确掌握玉米种子的鉴别方法，加强品种质量检验工作，对确保玉米高产具有重要意义。
随着玉米种博面积的扩大，玉米交种中需求急剧增加，由于一些种子部门的技术力量相对不足，部分制种田的田间检验和去杂去劣工作不及时，致使纯度降低，再者，有些地区种子生产缺乏有效的行政管理和繁育推广体系不够完善，也有些单位和个人滥引、滥繁、滥调、乱卖等较为严重。总之，玉米种子质量问题的技术原因，主要可归纳以下四个方面：
自交系繁殖田去杂不及时、不彻底．产生杂合粒；杂交制种田由于亲本纯度不高，去杂去劣不严格、不及时、不彻底，或母本自交系去雄不及时、不彻底，致使异品种株、本品种变异株或母本系散粉，产生非本品种的杂合粒和母本系自交粒。
隔离条件不符合要求，使异品种花粉传入，产生异种杂合籽粒。
由于种子收获、运输、晾晒、脱粒、贮藏中疏忽大意，混入了异品种种子。
个人无证繁育的种子，质量问题很多，但仍非法出售。
影响玉米杂交种纯度的杂株，一类是混杂株，一类是母本去雄不彻底造成的母本自交株。前者的粒型、穗型与典型杂交种有明显区别，易区分；后者从形态上与杂交种无法区别，但由于接受的花粉来源不同，籽粒胚乳层的颜色及透明度有不同表现。这种父本性状在杂交当代直接表现的现象称为花粉直感。据此，可直接将杂交粒勺母本自交粒区分开来。
普通玉米杂交种，籽粒类型可分为马齿型、半马齿型和硬粒型三种。从外形来分，有长木楔、木楔、短木楔、近圆、圆肾形。如果自交系或杂交种中混入了异品种种子，则可以根据籽粒的类型而鉴别。杂交种的形状、大小一般都象母本种子。如烟单14 号正交种（黄早四×Mo17）的形状、大小象母本黄早四，半马齿型、圆平、偏大；而反交种（Mo17×黄早四）却象母本Mo17，马齿型、粉粒、偏大。一般一个制种区的玉米杂交种形状大小比较均匀一致，二代种子比较均匀一致，但与杂交种相比，种于粒大、扁平、颜色浅，购种时应往意。
玉米种多的颜色通常有红、黄、白、紫等，生产中推广种植的以黄早四为母本的烟单14 号，反交掖单2号（黄卑四×掖107），由于黄早四的籽粒浅黄透明，接受父本Mo17、掖107的花粉后，所结杂交种籽粒的胚乳部分由原来浅黄透明变为红黄不透明，如果检查烟单14号、反交掖单2号种子中有浅黄透明粒存在，就是自交籽粒。以黄早四为父本的掖单 2号（掖 107×黄早四）、掖单4号（8112×黄早四），由于掖107籽粒为深黄顶、红黄粒，接受父本黄早四花粉后的杂交种籽粒为白顶，整个籽粒颜色比掖107 稍浅。8112顶盖和整个籽粒均为深黄色，看上去稍稍发红，发暗、无光泽；接受父本黄早四花粉后，所结杂交种的籽粒胚乳为浅黄透明，白顶、有光泽、籽粒稍发白。检查掖单2号种子有深黄顶、红黄粒，掖单4号种子有顶盖和整个籽粒均为深黄色粒存在时，则为自交粒，可挑出。农户购买种于后，由于用量有限，挑除自交粒是切实可行的。购买时看种子有无光泽主要是判断种子的新陈。色泽鲜亮是新收获的种子，色泽较暗的种子可能是隔年陈种。
杂交玉米种由于具有胚胎杂种优势，在一定的区域内相同的土壤和栽培管理条件下繁育的种子、杂交种比母本自交系种子粒重高。
一般杂交种粒大、饱满、整齐、生活力强，因而发芽势较母本自交系强。
种植鉴别是最准确最可靠的方法。它既适用于区分自交系与杂交种，又适于鉴定纯度。有三种方式：翌年种植；冬季就地温室种植；冬季海南岛异地鉴定。
种植鉴定主要根据幼苗性状如：叶鞘色、叶色、叶片宽窄、长短；植株性状如：植株高矮、粗细、叶片大小、角度；穗部性状如：雌穗形状、穗柄长度、果穗苞叶生长状况、穗型、穗轴粗细、穗轴色的异同，来鉴定纯度或区分自交系和杂交种。
甘肃农业大学植物大学，在玉米胚胎发育研究中对10个具有杂种优势的玉米杂交种及其亲本进行试验。观察看出，杂种胚胎组织分化提前，器官分化清晰，发育得好。所以，可以用生理测定的方法来区分自交系和杂交种。
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